43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3679 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
239 aa  487  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  49.08 
 
 
218 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  45.07 
 
 
225 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  32.61 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  33.51 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  34.57 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  32.28 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8121  hypothetical protein  36.02 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  29.66 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  31.74 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  32.48 
 
 
203 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  30.63 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  26.5 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  31.17 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1615  protein of unknown function DUF820  30.68 
 
 
197 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  31.21 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4494  hypothetical protein  32.06 
 
 
159 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  31.33 
 
 
189 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 
184 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  32.08 
 
 
202 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  32.88 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  29.22 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  26.74 
 
 
184 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  34.86 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  26.82 
 
 
193 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  26.73 
 
 
227 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
197 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  26.97 
 
 
187 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  26.16 
 
 
184 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0726  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.225388  normal  0.518771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  27.03 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  29.05 
 
 
191 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  26.34 
 
 
191 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  28.48 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  27.71 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  28.75 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  25.42 
 
 
182 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  27.71 
 
 
201 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  27.46 
 
 
209 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  31.41 
 
 
184 aa  42  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  29.01 
 
 
200 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  27.74 
 
 
186 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  28.95 
 
 
190 aa  41.6  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>