25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2602 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2602  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
275 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00334649  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  62.4 
 
 
264 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  57.08 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  58.8 
 
 
282 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  61.37 
 
 
261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  58.4 
 
 
262 aa  228  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  59.48 
 
 
339 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  57.45 
 
 
262 aa  201  9e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  41.31 
 
 
265 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  40.61 
 
 
267 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  40.61 
 
 
267 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  63.33 
 
 
662 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0671  hypothetical protein  56.55 
 
 
211 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0981085  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  37.29 
 
 
287 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  40.62 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  27.42 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  28.14 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  32 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  28.17 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  29.82 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.43 
 
 
308 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  28.25 
 
 
250 aa  42.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>