34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2449 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  698    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11420  hypothetical protein  61.5 
 
 
362 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  60.87 
 
 
338 aa  362  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  57.23 
 
 
338 aa  361  9e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  58.18 
 
 
336 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3358  hypothetical protein  54.71 
 
 
337 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  56.1 
 
 
333 aa  342  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6635  hypothetical protein  53.05 
 
 
337 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4939  hypothetical protein  55.39 
 
 
343 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4851  hypothetical protein  55.39 
 
 
343 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5218  hypothetical protein  55.39 
 
 
343 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4297  hypothetical protein  50.46 
 
 
331 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  48.84 
 
 
347 aa  285  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3393  hypothetical protein  46.71 
 
 
336 aa  275  8e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  47.9 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0465  hypothetical protein  43.58 
 
 
355 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399016  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13100  hypothetical protein  43.75 
 
 
360 aa  256  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3588  hypothetical protein  45.67 
 
 
351 aa  249  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0643  hypothetical protein  43.66 
 
 
356 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3964  hypothetical protein  44.58 
 
 
322 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18920  hypothetical protein  36.01 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.620455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  27.54 
 
 
368 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2773  hypothetical protein  26.19 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0775  hypothetical protein  27.32 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0574  hypothetical protein  26.45 
 
 
367 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1617  hypothetical protein  28.19 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0071  hypothetical protein  23.22 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  21.76 
 
 
364 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3700  hypothetical protein  24.22 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130422  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3868  hypothetical protein  26.85 
 
 
285 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312914  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3925  hypothetical protein  24.43 
 
 
310 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0745  cupin 2 protein  20.79 
 
 
477 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4825  hypothetical protein  26.46 
 
 
366 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.923521  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2434  hypothetical protein  24.42 
 
 
464 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>