51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1185 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1185  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  100 
 
 		 353 aa  681    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.423386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8414  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  39.68 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0506  hypothetical protein  34.63 
 
 		 357 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00681957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3889  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  33.72 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1748  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  28.51 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2319  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.15 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2904  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.36 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691931  normal  0.381223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1080  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.44 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1738  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.71 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0836  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.21 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3066  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.83 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1397  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.7 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2810  sigma factor algU regulatory protein MucB  25.72 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2471  sigma factor algU regulatory protein MucB  25.72 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0538  sigma factor algU regulatory protein MucB  25.72 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1794  sigma factor algU regulatory protein MucB  25.72 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.466338  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2846  sigma factor negative regulatory protein MucB/ResB family  25.72 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2784  sigma factor negative regulatory protein MucB/ResB family  25.72 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2899  sigma factor algU regulatory protein MucB  25.36 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1341  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  28.7 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0858  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.51 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0139704  normal  0.0156126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1002  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.51 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000271595  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1725  sigma factor algU regulatory protein MucB  25.15 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1100  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.36 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2093  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.09 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2464  MucB/RseB  27.32 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2175  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.19 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0644  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  28.63 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2920  hypothetical protein  32.17 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378243  hitchhiker  0.00688417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1085  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.8 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1469  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  31.17 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4241  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.88 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1129  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.88 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1005  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.61 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1087  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.88 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0649  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.88 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2261  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.27 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.314322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3244  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  30.43 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0603  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.14 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000201809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2625  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.42 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3272  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.58 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.215097  normal  0.161649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1009  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.16 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.597647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1057  putative sigma-E factor regulatory (negative regulator) transcription regulator protein  25.76 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0922  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2423  sigma E regulatory protein MucB/RseB  26.77 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2257  putative sigma-e factor  27.34 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54410  negative regulator for alginate biosynthesis MucB  27.34 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3641  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.14 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1429  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.46 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.046394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4378  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.46 
 
 		 321 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3956  MucB/RseB  26.9 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>