24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0506 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0506  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  703    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00681957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3889  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  37.85 
 
 		 360 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1185  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  34.31 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.423386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8414  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  34.18 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2093  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  32.03 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1341  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  23.28 
 
 		 339 aa  53.1  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0845  hypothetical protein  21.2 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000342315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2904  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  28.74 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691931  normal  0.381223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1100  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.46 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1080  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  28.48 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0836  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  28.57 
 
 		 346 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1397  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.09 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2261  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  29.69 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.314322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1085  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.18 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1748  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.93 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2257  putative sigma-e factor  25.6 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0644  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.9 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688474 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2464  MucB/RseB  27.22 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4241  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.63 
 
 		 350 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1087  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.97 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1738  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  23.26 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2899  sigma factor algU regulatory protein MucB  24.47 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1129  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.97 
 
 		 350 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0649  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.97 
 
 		 350 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>