20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0226 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0226  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
446 aa  875    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0396  hypothetical protein  73.13 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0183  hypothetical protein  66.67 
 
 
468 aa  286  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4611  protein of unknown function DUF88  55.36 
 
 
574 aa  276  8e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0253473  normal  0.838732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3005  hypothetical protein  72.16 
 
 
516 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5741  protein of unknown function DUF88  38.92 
 
 
435 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0769701  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  39.29 
 
 
388 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  36.36 
 
 
404 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1911  protein of unknown function DUF88  37.35 
 
 
484 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4132  protein of unknown function DUF88  38.38 
 
 
333 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0698  hypothetical protein  37.14 
 
 
304 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1318  hypothetical protein  35.63 
 
 
313 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  36.57 
 
 
335 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2603  hypothetical protein  33.56 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  35.14 
 
 
181 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1748  hypothetical protein  32.85 
 
 
284 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  26.29 
 
 
194 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  26.86 
 
 
194 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  26.29 
 
 
194 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  28.31 
 
 
219 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>