More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0019 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_03860  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 
1632 bp  1277    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0341976  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25530  16S ribosomal RNA  88.27 
 
 
1527 bp  1338    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0010  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 
1526 bp  1072    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  84.5 
 
 
1466 bp  912    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0018  16S ribosomal RNA  88.46 
 
 
1517 bp  1354    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.298469  normal  0.903608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12340  16S ribosomal RNA  88.27 
 
 
1527 bp  1344    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0065  16S ribosomal RNA  86.03 
 
 
1510 bp  831    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05560  16S ribosomal RNA  88.27 
 
 
1527 bp  1338    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0068  16S ribosomal RNA  89.42 
 
 
1507 bp  1461    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253796  decreased coverage  0.00746602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  84.5 
 
 
1466 bp  912    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0070  16S ribosomal RNA  88.08 
 
 
1534 bp  1059    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0736404  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  87.38 
 
 
1532 bp  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0039  16S ribosomal RNA  88.46 
 
 
1517 bp  1354    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0163381  hitchhiker  0.00923101 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  84.42 
 
 
1431 bp  904    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0005  16S ribosomal RNA  89.04 
 
 
1519 bp  1659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0297907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  91.34 
 
 
1501 bp  1645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  91.34 
 
 
1501 bp  1645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0045  16S ribosomal RNA  89.04 
 
 
1519 bp  1659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  87.38 
 
 
1532 bp  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0030  16S ribosomal RNA  89.04 
 
 
1519 bp  1659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  91.34 
 
 
1501 bp  1645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0001  16S ribosomal RNA  85.52 
 
 
1525 bp  1057    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.892874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0025  16S ribosomal RNA  89.33 
 
 
1471 bp  1126    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0044  16S ribosomal RNA  89.33 
 
 
1471 bp  1126    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0049  16S ribosomal RNA  89.33 
 
 
1471 bp  1126    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0067  16S ribosomal RNA  89.33 
 
 
1471 bp  1126    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0060  16S ribosomal RNA  88.97 
 
 
1505 bp  1421    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0064  16S ribosomal RNA  87.17 
 
 
1506 bp  1427    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0004  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 
1477 bp  690    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0018  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 
1477 bp  690    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0046  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 
1477 bp  690    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0064  16S ribosomal RNA  83.39 
 
 
1477 bp  690    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  84.94 
 
 
1555 bp  763    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07440  16S ribosomal RNA  88.27 
 
 
1527 bp  1338    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.496613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0011  16S ribosomal RNA  88.97 
 
 
1505 bp  1421    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0040  16S ribosomal RNA  91.42 
 
 
1512 bp  1663    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0048  16S ribosomal RNA  91.42 
 
 
1512 bp  1663    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.089973  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14290    86.97 
 
 
2926 bp  961    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0032  16S ribosomal RNA  87.89 
 
 
1532 bp  1047    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0057  16S ribosomal RNA  87.89 
 
 
1532 bp  1047    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0019  16S ribosomal RNA  88.08 
 
 
1534 bp  1059    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04500  16S ribosomal RNA  87.6 
 
 
1523 bp  1273    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0024  16S ribosomal RNA  88.68 
 
 
1515 bp  807    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0041  16S ribosomal RNA  88.55 
 
 
1515 bp  799    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00000734371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  86.83 
 
 
1513 bp  829    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 
1532 bp  712    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 
1532 bp  712    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13550  16S ribosomal RNA  87.6 
 
 
1523 bp  1273    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0361691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0016  16S ribosomal RNA  86.19 
 
 
1517 bp  841    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.672174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0021  16S ribosomal RNA  86.19 
 
 
1517 bp  841    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0029  16S ribosomal RNA  86.19 
 
 
1517 bp  841    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0064  16S ribosomal RNA  86.19 
 
 
1517 bp  841    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0067  16S ribosomal RNA  86.19 
 
 
1517 bp  841    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  91.42 
 
 
1509 bp  1671    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  88.57 
 
 
1498 bp  1316    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  88.57 
 
 
1498 bp  1316    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0035  16S ribosomal RNA  89.42 
 
 
1507 bp  1461    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000731111  normal  0.0208084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0053  16S ribosomal RNA  89.42 
 
 
1507 bp  1461    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0136831  normal  0.0232267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0032  16S ribosomal RNA  87.34 
 
 
1520 bp  745    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000901783  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0041  16S ribosomal RNA  87.34 
 
 
1520 bp  745    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0021  16S ribosomal RNA  88.68 
 
 
1515 bp  807    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.222363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0038  16S ribosomal RNA  88.55 
 
 
1515 bp  799    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000160883  decreased coverage  0.00357812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0027  16S ribosomal RNA  88.82 
 
 
1515 bp  815    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0042  16S ribosomal RNA  88.82 
 
 
1515 bp  815    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0519048  normal  0.0131861 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  87.38 
 
 
1532 bp  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  87.38 
 
 
1532 bp  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0009  16S ribosomal RNA  84.82 
 
 
1538 bp  662    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000955328  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0033  16S ribosomal RNA  85.03 
 
 
1538 bp  678    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0021  16S ribosomal RNA  88.68 
 
 
1515 bp  807    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812892  normal  0.0276093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0038  16S ribosomal RNA  88.68 
 
 
1515 bp  807    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00000101805  decreased coverage  0.0014476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0023  16S ribosomal RNA  88.46 
 
 
1513 bp  1364    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0040  16S ribosomal RNA  88.46 
 
 
1513 bp  1364    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0005  16S ribosomal RNA  89.11 
 
 
1528 bp  1663    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.022366  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0031  16S ribosomal RNA  89.11 
 
 
1528 bp  1663    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00134109  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0043  16S ribosomal RNA  89.11 
 
 
1528 bp  1663    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942291  normal  0.0921912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0023  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 
1505 bp  1441    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0039  16S ribosomal RNA  87.22 
 
 
1505 bp  1441    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  84.5 
 
 
1431 bp  912    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0007  16S ribosomal RNA  85.59 
 
 
1526 bp  1072    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01550  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 
1505 bp  666    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08380  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 
1505 bp  666    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.793427 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0004  16S ribosomal RNA  85.52 
 
 
1526 bp  1065    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07380  16S ribosomal RNA  88.27 
 
 
1527 bp  1344    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0389035  normal  0.172558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14046  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 
1540 bp  775    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.73486e-38  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0036  16S ribosomal RNA  86.85 
 
 
1512 bp  1402    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0700117  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0053  16S ribosomal RNA  86.85 
 
 
1512 bp  1402    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0060  16S ribosomal RNA  86.85 
 
 
1512 bp  1402    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.889945  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0063  16S ribosomal RNA  86.85 
 
 
1512 bp  1402    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0027  16S ribosomal RNA  89.68 
 
 
1511 bp  864    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0044  16S ribosomal RNA  89.68 
 
 
1511 bp  864    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0046  16S ribosomal RNA  89.65 
 
 
1505 bp  1445    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000115462  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0049  16S ribosomal RNA  89.65 
 
 
1505 bp  1445    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000269121  hitchhiker  0.000017659 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0079  16S ribosomal RNA  87.89 
 
 
1532 bp  1047    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21650  16S ribosomal RNA  87.6 
 
 
1523 bp  1273    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0589371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0020  16S ribosomal RNA  86.03 
 
 
1510 bp  831    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0015  16S ribosomal RNA  86.03 
 
 
1510 bp  831    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  86.21 
 
 
1541 bp  652    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0062  16S ribosomal RNA  86.03 
 
 
1510 bp  831    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0027  16S ribosomal RNA  86.03 
 
 
1510 bp  831    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  86.21 
 
 
1541 bp  652    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>