19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1522 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1522  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4856  transcriptional regulator, XRE family  72.22 
 
 		 247 aa  242  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8697  hypothetical protein  65.85 
 
 		 246 aa  228  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8671  hypothetical protein  65.85 
 
 		 246 aa  228  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4862  hypothetical protein  64.1 
 
 		 243 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8677  hypothetical protein  60.49 
 
 		 244 aa  197  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0132  hypothetical protein  46.34 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 282 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 392 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8966  hypothetical protein  46.58 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0337189  normal  0.659261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3120  hypothetical protein  44.72 
 
 		 249 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521151 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5995  XRE family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 182 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113764 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5594  XRE family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 182 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3032  helix-turn-helix domain-containing protein  38.59 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3181  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346295  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3169  hypothetical protein  38.1 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7030  hypothetical protein  23.84 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.292023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7026  hypothetical protein  22.67 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>