55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2479 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  64.05 
 
 		 249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  63.25 
 
 		 255 aa  271  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  56.9 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  51.11 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  38.2 
 
 		 332 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  37.36 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  35.82 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  35.36 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  32.71 
 
 		 331 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  36.23 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  33.96 
 
 		 330 aa  148  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  34.08 
 
 		 330 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  33.33 
 
 		 331 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  32.83 
 
 		 337 aa  138  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  32.95 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  32.7 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  32.58 
 
 		 331 aa  131  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  31.11 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  30.28 
 
 		 331 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  31.92 
 
 		 339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  29.75 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  35.87 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  30.04 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  30.91 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  30.23 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  29.33 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  29.95 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  29.41 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  26.99 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  27.39 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.57 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  25.52 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  25.11 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  23.72 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  22.11 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0608  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.14 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  24.69 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0669  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.94 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0113371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  28.81 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.66 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.29 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1237  respiratory nitrate reductase gamma chain  27.11 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13830  respiratory nitrate reductase gamma chain  27.11 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.792747  normal  0.19596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  36.19 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.19 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.58 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  36.19 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  36.19 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  35.24 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.24 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.24 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.29 
 
 		 229 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  20.71 
 
 		 261 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.24 
 
 		 229 aa  42  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>