16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1187 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1187  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 258 aa  527  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.422064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1268  glycoside hydrolase family protein  97.29 
 
 		 328 aa  517  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000451376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1188  glycoside hydrolase family protein  50.2 
 
 		 274 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0484925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1267  glycoside hydrolase family protein  49.8 
 
 		 274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0628  glycoside hydrolase family 12  40.08 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0151118  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2755  glycoside hydrolase family 12  32.5 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00186286  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1621  endo-1,4-beta-glucanase B  28.34 
 
 		 284 aa  99.4  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0135255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0847  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 410 aa  88.6  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1681  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1988  hypothetical protein  23.88 
 
 		 351 aa  72  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.705196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0464  solute binding protein-like protein  23.36 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0340  glycoside hydrolase family 12  24.28 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1627  glycoside hydrolase family 12  27.59 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0848  hypothetical protein  22.41 
 
 		 437 aa  50.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.420421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2966  Cellulase  28.47 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  22.54 
 
 		 393 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>