52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1049 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1049  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
391 aa  781    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0473085  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1063  ComEC/Rec2-related protein  88.75 
 
 
391 aa  680    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246434  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0733  ComEC/Rec2-related protein  28.35 
 
 
400 aa  99.4  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00014366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1410  ComEC/Rec2-related protein  29.23 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0315554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 
759 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  24.27 
 
 
689 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
757 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30 
 
 
722 aa  56.6  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  24.15 
 
 
720 aa  53.9  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  24.1 
 
 
511 aa  53.1  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.4 
 
 
761 aa  53.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  25.91 
 
 
738 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0243  ComEC/Rec2-related protein  22.44 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.91 
 
 
794 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  30.12 
 
 
551 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  28.72 
 
 
787 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  25.09 
 
 
735 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.91 
 
 
773 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  25.09 
 
 
735 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  30.71 
 
 
708 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  26.67 
 
 
674 aa  50.8  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  27.22 
 
 
593 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  29.11 
 
 
551 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.78 
 
 
780 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  24.36 
 
 
591 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  27.53 
 
 
752 aa  47  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.42 
 
 
822 aa  46.6  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.33 
 
 
773 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  25.59 
 
 
448 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.17 
 
 
798 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.9 
 
 
749 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.91 
 
 
773 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  33.56 
 
 
706 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  22.96 
 
 
439 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.59 
 
 
775 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  26.89 
 
 
825 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2149  ComEC/Rec2-related protein  26.06 
 
 
644 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.452162 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.86 
 
 
773 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.3 
 
 
773 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  27.19 
 
 
604 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.86 
 
 
772 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.86 
 
 
772 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.41 
 
 
773 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  29.71 
 
 
734 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.4 
 
 
818 aa  43.5  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1346  ComEC/Rec2-related protein  23.95 
 
 
759 aa  43.5  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.032062  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.77 
 
 
860 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  25.43 
 
 
773 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.8 
 
 
709 aa  43.5  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000127283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.8 
 
 
752 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.16 
 
 
791 aa  43.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.58 
 
 
654 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>