136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3523 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3523  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  709    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.839256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  81.21 
 
 		 344 aa  551  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0085  dehydratase  78.78 
 
 		 343 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2633  dehydratase  77.62 
 
 		 343 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0973  MaoC family protein  77.33 
 
 		 343 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2871  putative thiol ester dehydrase/isomerase  73.91 
 
 		 343 aa  521  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0813  hypothetical protein  66.96 
 
 		 343 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5003  dehydratase  61.71 
 
 		 349 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3627  MaoC domain protein dehydratase  61.47 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1201  MaoC-like dehydratase  58.4 
 
 		 353 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0913  dehydratase  57.26 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4172  dehydratase  56.98 
 
 		 353 aa  384  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1430  dehydratase  58 
 
 		 349 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3781  dehydratase  59.09 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3940  dehydratase  61.41 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1326  MaoC domain protein dehydratase  55.81 
 
 		 359 aa  381  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1970  dehydratase  58.1 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4075  MaoC domain protein dehydratase  58.81 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4465  dehydratase  58.57 
 
 		 347 aa  381  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4037  MaoC domain protein dehydratase  58.52 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4149  MaoC-like dehydratase  46.02 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4428  MaoC-like dehydratase  44.89 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000912806  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  28.85 
 
 		 344 aa  95.9  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  36.42 
 
 		 173 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  35.33 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  34 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  35.19 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  32.73 
 
 		 168 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  34.32 
 
 		 172 aa  79  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  33.55 
 
 		 149 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  33.33 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  32.1 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  34.16 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  34.9 
 
 		 150 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  32.45 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  33.56 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6829  hypothetical protein  26.96 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  31.95 
 
 		 171 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  30.32 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  30.32 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  29.01 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4299  dehydratase  30.41 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313691  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  32.43 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  32.24 
 
 		 150 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1584  dehydratase  36.67 
 
 		 166 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0906655  hitchhiker  0.00294488 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  31.54 
 
 		 152 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  33.33 
 
 		 161 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  28.48 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  28.48 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  28.48 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  33.56 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  31.82 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  29.68 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  31.33 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  33.33 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  34.46 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  33.33 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1615  acyl dehydratase-like protein  28.81 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  30.41 
 
 		 150 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4501  dehydratase  32.65 
 
 		 169 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  30.41 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  30.2 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 		 167 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  30.2 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0183  hypothetical protein  28 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  28.86 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  30.77 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0192  hypothetical protein  28 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  29.22 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  29.33 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0445  hypothetical protein  27.36 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  31.25 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  29.25 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  29.25 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  29.25 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  29.25 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  29.25 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  29.25 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  29.25 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  28.86 
 
 		 169 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  27.63 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0222  hypothetical protein  28.17 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  0.0567113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0172  hypothetical protein  26.94 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  28.67 
 
 		 174 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4181  Acyl dehydratase-like protein  24.93 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  31.29 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  26.8 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  30.46 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  30.46 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1582  dehydratase  28.24 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0997283  hitchhiker  0.00301397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  30.46 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  30 
 
 		 175 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  30 
 
 		 175 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  30 
 
 		 216 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  28 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0834  putative dehydratase  31.97 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0152637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  29.66 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  32.43 
 
 		 163 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.244814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  29.66 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.754163 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>