27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3460 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1088    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  34.18 
 
 		 545 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  29.96 
 
 		 553 aa  186  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  25 
 
 		 551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  25.87 
 
 		 550 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  27.22 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  25.65 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  27.54 
 
 		 542 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  25.46 
 
 		 548 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  26.46 
 
 		 552 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  24.17 
 
 		 551 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  25.98 
 
 		 558 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  24.49 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  23.25 
 
 		 550 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  23.91 
 
 		 552 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  24.33 
 
 		 509 aa  94.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  25.4 
 
 		 578 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  24.77 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  22.86 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  22.16 
 
 		 538 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  24.1 
 
 		 624 aa  75.5  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  25.3 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  24.52 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  26.44 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  22.42 
 
 		 509 aa  51.6  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  23.86 
 
 		 591 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  23.16 
 
 		 536 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>