133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2869 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2869  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868079  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  52.14 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  51.72 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  51.72 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  51.72 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  49.43 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2304  hypothetical protein  50.54 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000252834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  44.83 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  41.74 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  50.57 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0292  hypothetical protein  50.46 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.176418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0490  protein of unknown function DUF454  43.27 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000104879  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  49.43 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1454  hypothetical protein  39.32 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0600527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3072  hypothetical protein  45.54 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0894433  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  44.63 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  46.59 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  36.75 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2617  hypothetical protein  49.46 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000233192  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1165  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  56.16 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2237  hypothetical protein  53.52 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000431925  hitchhiker  0.000763101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  41.23 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2692  hypothetical protein  48.39 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000125494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1767  protein of unknown function DUF454  52.44 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000313735  hitchhiker  0.0045444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2576  hypothetical protein  52.44 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000163875  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2052  hypothetical protein  41.88 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0987297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0773  hypothetical protein  39.32 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2137  hypothetical protein  41.74 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.887096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  45.16 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1501  hypothetical protein  42.5 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0014  hypothetical protein  36.21 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4416  hypothetical protein  36.52 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  43.68 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  45.37 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  34.17 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  47.19 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  47.19 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3103  hypothetical protein  34.48 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362417  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  47.19 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  47.19 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  38.84 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1701  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0681358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  41.38 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  44.83 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  37.72 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  37.72 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  51.43 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0094  hypothetical protein  45.38 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.545096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  36.07 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  52.05 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  35.9 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  38.33 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2256  hypothetical protein  52.31 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000852478  normal  0.354843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  43.01 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1103  hypothetical protein  38.46 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2328  hypothetical protein  50.77 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000332693  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2448  hypothetical protein  50.77 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000286894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  47.3 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  36.84 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4220  hypothetical protein  40.17 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1003  hypothetical protein  39.5 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2383  hypothetical protein  38.71 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  42.31 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4856  hypothetical protein  32.74 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.715473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  56.45 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1282  hypothetical protein  36.67 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1041  hypothetical protein  38.66 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  50.68 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1506  hypothetical protein  43.1 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0208713  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0936  hypothetical protein  52.46 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6297  protein of unknown function DUF454  37.39 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4111  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04126  hypothetical protein  35.96 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1004  hypothetical protein  38.66 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  47.37 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1774  protein of unknown function DUF454  44.05 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.486547  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  54.84 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  46.05 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4381  hypothetical protein  37.4 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4506  hypothetical protein  34.75 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  54.84 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  54.84 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2306  protein of unknown function DUF454  36.67 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000646681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2502  hypothetical protein  38.94 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2296  hypothetical protein  29.57 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal  0.0252392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1578  protein of unknown function DUF454  30.43 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3311  protein of unknown function DUF454  35.34 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.639511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0722  hypothetical protein  35.63 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1817  hypothetical protein  38.26 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>