16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0194 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0194  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  27.17 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  29.01 
 
 		 446 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  27.67 
 
 		 576 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  28.4 
 
 		 445 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  37.84 
 
 		 537 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1432  hypothetical protein  27.59 
 
 		 416 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  28.67 
 
 		 481 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  31.78 
 
 		 537 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  31.78 
 
 		 537 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3577  hypothetical protein  28.4 
 
 		 444 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  25.61 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.55 
 
 		 1004 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  25.61 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  37.35 
 
 		 351 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3023  hypothetical protein  24.69 
 
 		 226 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>