177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0056 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.825759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0033  protein of unknown function DUF343  73.33 
 
 		 63 aa  94  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508144  hitchhiker  0.000474909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2369  hypothetical protein  68.85 
 
 		 63 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.77429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2896  hypothetical protein  73.21 
 
 		 59 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0949765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0424  hypothetical protein  65 
 
 		 66 aa  83.6  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1491  hypothetical protein  69.64 
 
 		 59 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  67.86 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0141  hypothetical protein  71.7 
 
 		 59 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.282587  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  68.52 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  67.92 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  62.9 
 
 		 63 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  67.92 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  62.96 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  62.96 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  62.3 
 
 		 61 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  62.26 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  62.26 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  62.26 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  62.26 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  59.26 
 
 		 59 aa  73.9  0.0000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  59.26 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  55.93 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  62.26 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1922  hypothetical protein  62.26 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  62.26 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  61.54 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  57.41 
 
 		 56 aa  71.6  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  56.45 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0891  hypothetical protein  60.71 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  60.38 
 
 		 430 aa  71.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0835  hypothetical protein  60.71 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  60.38 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3286  hypothetical protein  58.93 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  60.38 
 
 		 68 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  60.38 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  62.26 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  58.49 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  60.38 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2950  hypothetical protein  58.49 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  62.75 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  52.46 
 
 		 62 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  58.49 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  56.6 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  60.78 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  60.78 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3569  hypothetical protein  59.26 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0331586  hitchhiker  0.00582787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  50.82 
 
 		 62 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  60 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  60.78 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  60.78 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  62.75 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  52.73 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1098  hypothetical protein  55.77 
 
 		 58 aa  66.2  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.647732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  60.78 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  60.78 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  60.78 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  60.78 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  60.78 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  50.82 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  58.82 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  58.82 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  58.82 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  58.82 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  58.82 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  58.82 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  56.6 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  56.86 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  56.86 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  56.86 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  56.86 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  53.7 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  50.82 
 
 		 62 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2800  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4588  hypothetical protein  58.82 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.658837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  58.49 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  48.15 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  48.15 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  48.15 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1559  hypothetical protein  48.15 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.730399  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1052  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.202264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  53.7 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1707  hypothetical protein  48.15 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.502492  normal  0.508919 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0993  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638813  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2672  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0296171  normal  0.0260721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1020  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.678169 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1685  hypothetical protein  48.15 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  49.06 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1670  hypothetical protein  48.15 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2197  hypothetical protein  50 
 
 		 56 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  49.06 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>