31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1738 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1738  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 144 aa  299  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.265595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2654  cyclase/dehydrase  45.71 
 
 		 140 aa  126  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  40.15 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2487  Polyketide cyclase/dehydrase  35.25 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  24.53 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  25.93 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  28.81 
 
 		 244 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1645  bacterio-opsin linked product  27.08 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  26.44 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  22.76 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  25.29 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  24.78 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3174  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1021  cyclase/dehydrase  26.57 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  26.72 
 
 		 225 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  28.21 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  22.38 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  24.46 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  29.2 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  25.58 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  29.33 
 
 		 256 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  21.93 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  20.39 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  25.88 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  25.64 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  22.76 
 
 		 328 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  27 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 		 203 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2469  hypothetical protein  29.7 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  21.01 
 
 		 241 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>