17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1564 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  100 
 
 		 137 aa  270  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  38.69 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  33.81 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  32.06 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  27.13 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  30.47 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  27.91 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  26.4 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  25.76 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  27.2 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0334  PilT protein-like  25.19 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1966  hypothetical protein  40.82 
 
 		 51 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293017 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  26.56 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  27.18 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  25.42 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  27.78 
 
 		 153 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>