15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11973 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11973  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2687  SEC-C motif domain protein  64.29 
 
 
337 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.182718 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  36.46 
 
 
864 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  70.83 
 
 
420 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2356  methionine aminopeptidase, type I  76.19 
 
 
294 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.919719  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  43.4 
 
 
855 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3479  methionine aminopeptidase, type I  64 
 
 
291 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.234162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  41.94 
 
 
859 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  39.29 
 
 
834 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  48.89 
 
 
111 aa  42  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  26.61 
 
 
397 aa  42  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2144  SecC motif-containing protein  53.12 
 
 
601 aa  41.6  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  34.88 
 
 
928 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  41.51 
 
 
864 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 
872 aa  41.2  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>