212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2270 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2270  glucanase  100 
 
 
344 aa  696    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  58.06 
 
 
346 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  60.18 
 
 
349 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4635  peptidase M42 family protein  49.55 
 
 
348 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148815  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36500  hypothetical protein  35.5 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0413589  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2999  peptidase M42 family protein  34.49 
 
 
351 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3132  hypothetical protein  35.03 
 
 
358 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0718  peptidase M42 family protein  32.85 
 
 
363 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  27.59 
 
 
340 aa  98.6  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  26.91 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0680  peptidase M42 family protein  26.3 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  24.78 
 
 
343 aa  89.7  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  26.89 
 
 
340 aa  89.4  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  28.11 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2113  peptidase M42  29.65 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1433  Cellulase  27.3 
 
 
340 aa  86.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  27.38 
 
 
396 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  26.37 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  29.91 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  29.91 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0609  peptidase M42 family protein  25.27 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.467193  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  26.53 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  26.53 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0815  peptidase M42 family protein  25.71 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1121  peptidase M42 family protein  23.99 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  23.88 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  26.76 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  27.9 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  26.82 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  25.36 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  28.2 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1571  peptidase M42 family protein  26.37 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  29.21 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  26.11 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  25.44 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  28.2 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  25.36 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  24.69 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  25.07 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  25.15 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  25.07 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  25.29 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  25.29 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  25.29 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  25.07 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  25.29 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  25.96 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  25.87 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  25.29 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  25.87 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  24.28 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  25.67 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  24.21 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  25.41 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  25.72 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  24.48 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  27.91 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0602  peptidase M42 family protein  27.41 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  27.62 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0206  cellulase  27.34 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  29.1 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  23.19 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  25.17 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1702  peptidase M42 family protein  22.95 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  25.17 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  25.17 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04171  predicted endoglucanase with Zn-dependent exopeptidase domain  25.96 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3694  peptidase M42 family protein  25.96 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  25.17 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04133  hypothetical protein  25.96 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  26.67 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  25.17 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  25.44 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  27.18 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  25.07 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  26.78 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0546  hypothetical protein  25.73 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1790  sgc region protein SgcX  25.21 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00171255  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  24.02 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0522  hypothetical protein  24.92 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  25.59 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  24.34 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  25 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1549  putative sgc region protein SgcX  24.93 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  24.83 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  23.82 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  24.34 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  24.86 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0048  peptidase M42 family protein  27.68 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  25.17 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1730  hypothetical protein  24.93 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.771203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1726  sgc region protein SgcX  24.93 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1729  putative sgc region protein SgcX  24.64 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0433  glutamyl aminopeptidase  25.4 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  23.79 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  24.06 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  23.45 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  22.58 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0682  peptidase M42 family protein  25.2 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0895  Cellulase  26.13 
 
 
355 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>