13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2010 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2010  cytochrome c-550  100 
 
 
215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2746  cytochrome c-550  67.9 
 
 
163 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0961  cytochrome c-550  61.73 
 
 
163 aa  220  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  62.96 
 
 
162 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2686  cytochrome c, class I  54.04 
 
 
161 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2146  cytochrome c-550  50.3 
 
 
186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.117545 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0531  cytochrome c-550  49.4 
 
 
170 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0845307  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3109  cytochrome c-550  45.68 
 
 
161 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05311  cytochrome c-550  43.71 
 
 
170 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4309  cytochrome c-550  42.59 
 
 
160 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4370  cytochrome c-550  42.59 
 
 
160 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  38.81 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  38.3 
 
 
165 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>