32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1974 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 278 aa  548  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  42.05 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  45.15 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  47.12 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  44.6 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.08 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  41.92 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.45 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.24 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.24 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  44.4 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  42.86 
 
 		 297 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  45.91 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.26 
 
 		 286 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  38.06 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  37.31 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  37.27 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  35.56 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.88 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.86 
 
 		 405 aa  79  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.06 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.37 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.27 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  27.09 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.94 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.77 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.42 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  25.49 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  33.1 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.75 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.19 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  20.7 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>