36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1905 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  427  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  69.5 
 
 
203 aa  304  6e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  47.12 
 
 
197 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  46.11 
 
 
194 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  41.88 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  36.09 
 
 
188 aa  128  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  34.05 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  33.16 
 
 
200 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  33.16 
 
 
200 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  33.15 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  35.5 
 
 
188 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  33.14 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  33.53 
 
 
177 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  29.24 
 
 
193 aa  99  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  31.36 
 
 
176 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  31.36 
 
 
176 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  32.54 
 
 
179 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  28.24 
 
 
174 aa  90.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  28.88 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  30.81 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  31.61 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  30.51 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  27.54 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  31.25 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  30.63 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  27.53 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  31.85 
 
 
161 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  26.44 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  27.04 
 
 
164 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  26.04 
 
 
172 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  27.78 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  29.14 
 
 
183 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  26.28 
 
 
186 aa  48.9  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0543  hypothetical protein  23.9 
 
 
179 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0182  hypothetical protein  26.11 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0177  hypothetical protein  26.11 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00664238  normal  0.338946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>