22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2243 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  100 
 
 		 404 aa  833    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  28.35 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 390 aa  136  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  28.31 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  24.69 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0939  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  24.04 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  24.04 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  22.11 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  24.91 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  22.22 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  22.91 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03451  hypothetical protein  71.88 
 
 		 51 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.51954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12991  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  21.38 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  22.38 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2571  phage integrase family protein  23.13 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  21.78 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>