69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2130 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2130  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.143043  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0544  hypothetical protein  84.4 
 
 		 250 aa  434  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240626  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0917  SAM-dependent methyltransferase  60.33 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17731  hypothetical protein  60.33 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.252781  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14001  hypothetical protein  67 
 
 		 206 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15071  hypothetical protein  49.59 
 
 		 247 aa  254  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4288  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15471  hypothetical protein  50.45 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.109184  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15321  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.579815  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1444  hypothetical protein  49.33 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3277  Methyltransferase type 11  46.03 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2822  Methyltransferase type 11  46.03 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 317 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.2 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 753 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.05 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  31.71 
 
 		 414 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.98 
 
 		 420 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.04 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.74 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.53 
 
 		 423 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  35.64 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  34.69 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.36 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1216  methyltransferase type 11  26.49 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.218616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.36 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 400 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.9 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  28.06 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3479  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.24 
 
 		 413 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.949619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.96 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0492  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.86 
 
 		 428 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.1 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 400 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3277  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  28.85 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.58 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 187 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0098  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  38.46 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 221 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 382 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.63 
 
 		 398 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.09 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0108  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 194 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35 
 
 		 424 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1926  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.99 
 
 		 306 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 256 aa  42  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.82 
 
 		 272 aa  42  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 238 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 242 aa  42  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 399 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>