43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0917 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_17731  hypothetical protein  99.19 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.252781  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0917  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2130  hypothetical protein  60.33 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.143043  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0544  hypothetical protein  59.92 
 
 		 250 aa  319  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240626  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14001  hypothetical protein  62.75 
 
 		 206 aa  288  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15071  hypothetical protein  54.03 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15321  hypothetical protein  55.56 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.579815  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1444  hypothetical protein  55.11 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15471  hypothetical protein  54.22 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.109184  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3277  Methyltransferase type 11  47.08 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2822  Methyltransferase type 11  47.08 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4288  hypothetical protein  47.26 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  32.2 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.91 
 
 		 420 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.08 
 
 		 414 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  24.8 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.07 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.49 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 753 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 400 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 400 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 282 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.23 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  30.1 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  25.86 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.68 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2359  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.1 
 
 		 412 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0187  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.07 
 
 		 396 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00117459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  24.81 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.73 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.93 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1748  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.15 
 
 		 396 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.829611  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 434 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  30.48 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 441 aa  42  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.17 
 
 		 217 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  28.1 
 
 		 306 aa  42  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>