44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_17731 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_17731  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  507  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.252781  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0917  SAM-dependent methyltransferase  99.19 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2130  hypothetical protein  60.33 
 
 
254 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.143043  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0544  hypothetical protein  59.5 
 
 
250 aa  318  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240626  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14001  hypothetical protein  62.25 
 
 
206 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15071  hypothetical protein  53.63 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1444  hypothetical protein  55.11 
 
 
224 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15321  hypothetical protein  55.11 
 
 
224 aa  261  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.579815  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15471  hypothetical protein  53.78 
 
 
224 aa  255  4e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.109184  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3277  Methyltransferase type 11  47.08 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2822  Methyltransferase type 11  47.08 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4288  hypothetical protein  47.26 
 
 
247 aa  221  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
283 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.08 
 
 
414 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  32.2 
 
 
317 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  25 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.07 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
753 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.49 
 
 
276 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.91 
 
 
420 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 
400 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 
400 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  25.86 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.93 
 
 
276 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
282 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2359  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.1 
 
 
412 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  30.1 
 
 
399 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0187  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.07 
 
 
396 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00117459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  28.46 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  24.81 
 
 
341 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1748  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.92 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.829611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.68 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1926  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.28 
 
 
306 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.93 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  29.6 
 
 
254 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 
434 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  28.23 
 
 
441 aa  42.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  32.04 
 
 
779 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.67 
 
 
865 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>