16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4013 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4013  hypothetical protein  100 
 
 		 751 aa  1563    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0086  hypothetical protein  25.39 
 
 		 779 aa  185  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2177  hypothetical protein  32.53 
 
 		 734 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  29.3 
 
 		 689 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  26.61 
 
 		 676 aa  80.9  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  26.34 
 
 		 693 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  26.34 
 
 		 693 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  26.34 
 
 		 693 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  22.2 
 
 		 624 aa  65.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  23.92 
 
 		 655 aa  65.1  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  24.11 
 
 		 745 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  23.53 
 
 		 681 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  28.06 
 
 		 561 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  25 
 
 		 667 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2308  hypothetical protein  19.57 
 
 		 715 aa  45.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  25.97 
 
 		 543 aa  44.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>