44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1043 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1043  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  221  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  45.26 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  44.79 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  44.79 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  44.79 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  43.75 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  40.62 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4051  hypothetical protein  39 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1581  tellurite resistance protein TehB  38.78 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  34.41 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0673  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.42373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2790  hypothetical protein  33.64 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2202  hypothetical protein  36.73 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1510  tellurite resistance protein TehB  38.54 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1325  tellurite resistance protein TehB  38.54 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000904817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1950  tellurite resistance protein TehB  38.54 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2006  tellurite resistance protein TehB  38.54 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.626441  normal  0.647041 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001303  putative cytoplasmic protein  37.37 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.493393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2522  hypothetical protein  32.32 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1946  tellurite resistance protein TehB  37.5 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0369899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1836  hypothetical protein  32.32 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1846  Protein of unknown function DUF1971  32.32 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1885  hypothetical protein  32.32 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1392  hypothetical protein  32.32 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.701961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1376  hypothetical protein  32.04 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0147677  hitchhiker  0.0000627651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1392  hypothetical protein  32.04 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.212785  normal  0.209101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1360  hypothetical protein  32.04 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0565262  normal  0.44217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1910  hypothetical protein  32.04 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00002925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2091  hypothetical protein  32.04 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182106  hitchhiker  0.00000274218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1354  hypothetical protein  31.58 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2752  Protein of unknown function DUF1971  29.47 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2987  Protein of unknown function DUF1971  30.53 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2121  hypothetical protein  29.47 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.410943 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46343  predicted protein  26.42 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22985  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  26.19 
 
 		 291 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  25.32 
 
 		 292 aa  47.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  26.25 
 
 		 295 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  26.25 
 
 		 295 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  26.25 
 
 		 295 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01754  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  27.71 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1573  tellurite resistance-like domain-containing protein  29.29 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0302  hypothetical protein  31.25 
 
 		 172 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00596273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>