299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_R0054 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  96.92 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  89.7  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 81 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 81 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 81 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 81 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 81 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 81 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 80 bp  77.8  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 80 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0057  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 80 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0744744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0076  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737133  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0037  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17135  normal  0.776036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0079  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.966299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0048  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.547841 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0024  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0017  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0021  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0024  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0064  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169248 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0039  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813097 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>