More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1234 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 396 aa  807    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  76.02 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  75.38 
 
 		 395 aa  623  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  73.28 
 
 		 403 aa  618  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  73.48 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  72.91 
 
 		 399 aa  607  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  73.16 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  73.16 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  72.41 
 
 		 399 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  72.91 
 
 		 399 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  72.91 
 
 		 399 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  72.66 
 
 		 399 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  72.91 
 
 		 399 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  72.52 
 
 		 403 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  72.91 
 
 		 399 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  72.66 
 
 		 399 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  72.66 
 
 		 399 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  73.1 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  71.72 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  71.97 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  71.97 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  71.57 
 
 		 393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  69.9 
 
 		 395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  68.69 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  68.18 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  69.39 
 
 		 402 aa  569  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  69.04 
 
 		 402 aa  566  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  69.31 
 
 		 395 aa  567  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  67.52 
 
 		 396 aa  560  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  69.23 
 
 		 391 aa  555  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  69.23 
 
 		 391 aa  555  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  65.22 
 
 		 399 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  66.16 
 
 		 405 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  64.71 
 
 		 398 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  64.71 
 
 		 398 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  63.85 
 
 		 406 aa  529  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  64.39 
 
 		 405 aa  528  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  65.47 
 
 		 395 aa  530  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  63.59 
 
 		 406 aa  529  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  64.89 
 
 		 405 aa  530  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  63.59 
 
 		 406 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  65.99 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  64.56 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  63.18 
 
 		 401 aa  521  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  64.89 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  64.05 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  65.82 
 
 		 393 aa  518  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  64.43 
 
 		 417 aa  511  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  64.19 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  61.99 
 
 		 389 aa  508  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  64.14 
 
 		 389 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 		 390 aa  508  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  63.27 
 
 		 402 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  62.78 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  64.12 
 
 		 396 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  63.94 
 
 		 402 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  61.58 
 
 		 393 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  63.61 
 
 		 391 aa  502  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  60.66 
 
 		 387 aa  501  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  61.62 
 
 		 383 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  61.62 
 
 		 383 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  61.32 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  61.62 
 
 		 383 aa  502  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 383 aa  501  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  64.97 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  63.04 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  61.11 
 
 		 383 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  61.62 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  64.52 
 
 		 391 aa  500  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  61.87 
 
 		 385 aa  501  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  64.14 
 
 		 389 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  61.62 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  61.62 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  61.27 
 
 		 388 aa  499  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  64.03 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  60.86 
 
 		 383 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  63.82 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  63.2 
 
 		 388 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  56.9 
 
 		 395 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  62.66 
 
 		 398 aa  496  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  60.35 
 
 		 384 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  61.96 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  61.73 
 
 		 388 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 		 384 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  61.36 
 
 		 383 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  61.36 
 
 		 383 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  60.86 
 
 		 383 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>