15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5338 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  100 
 
 		 1934 aa  3880    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  35.03 
 
 		 985 aa  70.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1625 aa  65.9  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0820  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1034 aa  61.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0748  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1026 aa  61.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0425394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0092  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1202 aa  56.6  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7241  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1067 aa  53.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 1672 aa  51.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  32 
 
 		 2543 aa  50.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2133  hypothetical protein  34.41 
 
 		 554 aa  48.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7212  HSP90 family heat shock protein  37.96 
 
 		 1315 aa  47.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2928  hypothetical protein  36.45 
 
 		 1284 aa  48.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8899  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1043 aa  48.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0830  hypothetical protein  32.34 
 
 		 847 aa  47.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0995213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 1687 aa  45.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>