More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5078 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5078  transposase IS66  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  76.37 
 
 		 553 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  71.65 
 
 		 551 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  59.66 
 
 		 549 aa  295  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  64.29 
 
 		 524 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  64.29 
 
 		 537 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  66.84 
 
 		 538 aa  278  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  66.84 
 
 		 549 aa  271  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  61.26 
 
 		 562 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  65.26 
 
 		 533 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4608  transposase IS66  67.43 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0241583  normal  0.199267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  60.62 
 
 		 552 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  60.62 
 
 		 552 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  60.62 
 
 		 552 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1584  hypothetical protein  61.66 
 
 		 361 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  65.38 
 
 		 540 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0399  transposase IS66  56.31 
 
 		 461 aa  219  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402856  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  48.35 
 
 		 556 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  51.71 
 
 		 527 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  51.71 
 
 		 527 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  49.58 
 
 		 535 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3169  putative IS66 transposase, TnpC  43.23 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180033  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  40.57 
 
 		 531 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  37.24 
 
 		 516 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  39.32 
 
 		 438 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  44.79 
 
 		 532 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  39.74 
 
 		 512 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  39.32 
 
 		 512 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  39.41 
 
 		 520 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  39.32 
 
 		 512 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  39.32 
 
 		 512 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  39.32 
 
 		 512 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  39.32 
 
 		 512 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  39.32 
 
 		 512 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  39.32 
 
 		 512 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 512 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 512 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 512 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 512 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 512 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 512 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 512 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 512 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 512 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  38.01 
 
 		 512 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  38.01 
 
 		 512 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  38.01 
 
 		 512 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  38.01 
 
 		 512 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  38.01 
 
 		 512 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  38.01 
 
 		 512 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  38.01 
 
 		 512 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  38.01 
 
 		 512 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  38.01 
 
 		 512 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  38.01 
 
 		 512 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0733  transposase IS66  42.71 
 
 		 434 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  45.77 
 
 		 508 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  32.22 
 
 		 521 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  37.87 
 
 		 523 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  37.87 
 
 		 523 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  37.87 
 
 		 523 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  37.87 
 
 		 523 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  37.87 
 
 		 523 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  37.45 
 
 		 523 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  33.67 
 
 		 522 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  36.82 
 
 		 531 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  37.45 
 
 		 523 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  37.93 
 
 		 522 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  37.4 
 
 		 542 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  37.92 
 
 		 545 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  36.84 
 
 		 537 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  34.63 
 
 		 524 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  37.5 
 
 		 545 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  37.5 
 
 		 545 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>