15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5030 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5030  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  342  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229828  normal  0.7799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  41.13 
 
 		 224 aa  101  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  44.25 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  34.51 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  34.17 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  32.54 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  28.29 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  30.99 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  27.69 
 
 		 242 aa  50.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  23.72 
 
 		 233 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  25.16 
 
 		 271 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  35.48 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  28.57 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1294  hypothetical protein  22.31 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>