26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4186 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  335  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  43.87 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  42.41 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3613  hypothetical protein  44.24 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2101  hypothetical protein  42.59 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3907  hypothetical protein  43.03 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.801532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2163  hypothetical protein  41.98 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2502  hypothetical protein  42.33 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.88856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3899  hypothetical protein  42.51 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5085  hypothetical protein  43.29 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.6936 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0321  hypothetical protein  45.39 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3519  hypothetical protein  42.94 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0333839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5349  hypothetical protein  42.33 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.570428  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0745  hypothetical protein  40.65 
 
 		 183 aa  94.4  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3810  hypothetical protein  36.81 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622372  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  31.94 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  33.11 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  29.56 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  37.74 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  32.35 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  30.71 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  30.88 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  33.63 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  26.6 
 
 		 150 aa  40.8  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>