20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3202 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3202  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  368  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59985  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  33.9 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  32.8 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1320  2'-5' RNA ligase  34.21 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0321525  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  34.92 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  33.52 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2222  hypothetical protein  36 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  32.95 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2337  Phosphoesterase HXTX  32.4 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4293  2',5' RNA ligase  30.11 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.775847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4557  2',5' RNA ligase  31.49 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0162437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1918  putative ligase  33.15 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102106  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2787  2'-5' RNA ligase  39.71 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01767  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.680529  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2923  2',5' RNA ligase  44.74 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916331  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  32.74 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  31.41 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>