44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1652 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  482  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.2 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2405  glutathione S-transferase-like  36.7 
 
 		 279 aa  144  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7062  Glutathione S-transferase domain protein  37.5 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  36.67 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4820  Glutathione S-transferase domain  35.32 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  32.72 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  36.32 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.48 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0774  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.55 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3099  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.99 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.937068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  34.96 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.51 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.247558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  32.49 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  32.49 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  31.47 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  27.96 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1599  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.89 
 
 		 226 aa  88.6  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  28.71 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  27.49 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  24.49 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  28.09 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02948  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07930)  22.93 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  25.89 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  26.56 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  24.73 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  26.6 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29981  predicted protein  23.24 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  22.56 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3483  maleylacetoacetate isomerase  28.97 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.19 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02180  hypothetical protein  33.71 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.36 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  23.74 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  24.73 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.76 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  26.09 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2422  glutathione S-transferase-like protein  29.41 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.43 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  31.03 
 
 		 214 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  31.03 
 
 		 214 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  31.03 
 
 		 214 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>