31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1187 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  100 
 
 		 236 aa  470  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  63.39 
 
 		 217 aa  231  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  34.05 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  33.93 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  37.56 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  28.03 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  30.73 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  27.94 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  26.22 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  27.09 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  29.15 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  33 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  32.75 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  32.91 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  28.14 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  25.43 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  28.89 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  29.49 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  36.02 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  29.66 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  23.7 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  28.89 
 
 		 311 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.8 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3390  hypothetical protein  28.31 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2488  methyltransferase type 11  38.04 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  30.2 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  27.37 
 
 		 269 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>