46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31720 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31720  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  938    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8517  hypothetical protein  64.22 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236902  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2345  LigA  59.14 
 
 		 490 aa  510  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.800961  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0239  hypothetical protein  34.09 
 
 		 411 aa  206  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.780841  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5886  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  31.62 
 
 		 708 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1209  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  30 
 
 		 725 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.104805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1960  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  32.26 
 
 		 722 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0700058  normal  0.240709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3533  feruloyl esterase  28.03 
 
 		 564 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1270  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  30 
 
 		 725 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.822984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1981  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  32.2 
 
 		 707 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3005  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  29.66 
 
 		 750 aa  51.2  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120032  normal  0.671328 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2060  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  29.35 
 
 		 726 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173492  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5988  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  29.37 
 
 		 707 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.470652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3044  feruloyl esterase  28.35 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0953377  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2028  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  30.93 
 
 		 699 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1890  putative lipoprotein  30.93 
 
 		 699 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3184  alpha/beta fold family hydrolase  30.93 
 
 		 699 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.368855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3147  putative lipoprotein  30.93 
 
 		 699 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2720  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  30.93 
 
 		 699 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0886  hypothetical protein  30.93 
 
 		 699 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1334  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  30.93 
 
 		 725 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.486001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3200  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  30.93 
 
 		 699 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0840  hypothetical protein  31.31 
 
 		 696 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0357  hypothetical protein  31.31 
 
 		 696 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.915085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0812  hypothetical protein  31.31 
 
 		 696 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5482  Tannase and feruloyl esterase  27.62 
 
 		 597 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2223  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate- oligomer hydrolase  29.2 
 
 		 707 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0731014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3932  hypothetical protein  31.31 
 
 		 696 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2985  hypothetical protein  22.8 
 
 		 501 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0083  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  32.28 
 
 		 700 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5301  putative feruloyl esterase  28.57 
 
 		 559 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.61 
 
 		 626 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1420  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  29.9 
 
 		 698 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0831  chlorogenate esterase  32.03 
 
 		 574 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0634  chlorogenate esterase  32.03 
 
 		 574 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3022  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  29.2 
 
 		 704 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0965207  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2544  hypothetical protein  28.23 
 
 		 697 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737003  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1795  chlorogenate esterase  32.03 
 
 		 574 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136386  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0245  Tannase and feruloyl esterase  28.79 
 
 		 560 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3696  feruloyl esterase  28.68 
 
 		 576 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0593  feruloyl esterase  29.66 
 
 		 552 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4873  feruloyl esterase  27.78 
 
 		 587 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24063  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0055  feruloyl esterase  28.47 
 
 		 573 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.980773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0736  hypothetical protein  30.61 
 
 		 695 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7130  Tannase  26.8 
 
 		 555 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000264682  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1073  tannase/feruloyl esterase family protein  31.25 
 
 		 574 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>