35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1960 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1334  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  56.73 
 
 		 725 aa  701    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.486001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3005  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  57.46 
 
 		 750 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120032  normal  0.671328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1960  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 722 aa  1459    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0700058  normal  0.240709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1209  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  56.95 
 
 		 725 aa  742    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.104805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1270  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  56.09 
 
 		 725 aa  737    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.822984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1981  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  62.03 
 
 		 707 aa  831    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2223  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate- oligomer hydrolase  49.58 
 
 		 707 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0731014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3022  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  50.63 
 
 		 704 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0965207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0719  hypothetical protein  49.85 
 
 		 695 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.642996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2544  hypothetical protein  49.41 
 
 		 697 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737003  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0736  hypothetical protein  49.78 
 
 		 695 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3987  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  50.42 
 
 		 718 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0395504  normal  0.53474 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3932  hypothetical protein  48.52 
 
 		 696 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550335 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3200  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  48.24 
 
 		 699 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5988  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  49.15 
 
 		 707 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.470652 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3147  putative lipoprotein  48.24 
 
 		 699 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2028  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  48.09 
 
 		 699 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1890  putative lipoprotein  48.09 
 
 		 699 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3184  alpha/beta fold family hydrolase  48.24 
 
 		 699 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.368855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2720  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  48.09 
 
 		 699 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0886  hypothetical protein  47.95 
 
 		 699 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0812  hypothetical protein  49.57 
 
 		 696 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0840  hypothetical protein  49.43 
 
 		 696 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0357  hypothetical protein  49.43 
 
 		 696 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.915085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4732  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  50 
 
 		 706 aa  587  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1420  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  47.83 
 
 		 698 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4280  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  47.47 
 
 		 729 aa  561  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5886  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  48.08 
 
 		 708 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3542  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  47.14 
 
 		 688 aa  535  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.078354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0749  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  46.39 
 
 		 682 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0083  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  44.75 
 
 		 700 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2060  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  44.31 
 
 		 726 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2556  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  43.74 
 
 		 734 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3290  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase  39.25 
 
 		 678 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31720  hypothetical protein  32.26 
 
 		 457 aa  52.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>