36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1981 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1334  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  56.52 
 
 
725 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.486001  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3005  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  56.01 
 
 
750 aa  705    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120032  normal  0.671328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1960  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  61.39 
 
 
722 aa  803    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0700058  normal  0.240709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4732  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  52.61 
 
 
706 aa  641    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3022  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  53.87 
 
 
704 aa  662    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0965207  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1209  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  56.57 
 
 
725 aa  749    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.104805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1270  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  56.98 
 
 
725 aa  754    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.822984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1981  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  100 
 
 
707 aa  1433    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2544  hypothetical protein  50.21 
 
 
697 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737003  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2223  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate- oligomer hydrolase  51.41 
 
 
707 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0731014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3987  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  53.47 
 
 
718 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0395504  normal  0.53474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5988  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  50.99 
 
 
707 aa  622  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.470652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3932  hypothetical protein  49.51 
 
 
696 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0357  hypothetical protein  50.21 
 
 
696 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.915085  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0840  hypothetical protein  50.21 
 
 
696 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0812  hypothetical protein  49.79 
 
 
696 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312439  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2028  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  50.29 
 
 
699 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706846  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3184  alpha/beta fold family hydrolase  50.29 
 
 
699 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.368855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3200  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  50.43 
 
 
699 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0719  hypothetical protein  50.22 
 
 
695 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.642996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3147  putative lipoprotein  50.43 
 
 
699 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2720  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  50.29 
 
 
699 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1890  putative lipoprotein  50.29 
 
 
699 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0886  hypothetical protein  50.14 
 
 
699 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0736  hypothetical protein  50.36 
 
 
695 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.173943 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5886  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  50.3 
 
 
708 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1420  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  50.43 
 
 
698 aa  588  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4280  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  47.84 
 
 
729 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3542  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  48.96 
 
 
688 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.078354  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0749  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  47.69 
 
 
682 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244623  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0083  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  45.44 
 
 
700 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2060  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  42.74 
 
 
726 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2556  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  43.74 
 
 
734 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.405834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3290  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase  43.16 
 
 
678 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31720  hypothetical protein  32.2 
 
 
457 aa  51.2  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  27.65 
 
 
275 aa  43.9  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>