40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30380 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30380  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  100 
 
 		 167 aa  324  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1797  cation antiporter  41.57 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1206  cation antiporter  36.99 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0203204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3144  cation antiporter  35.37 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.35 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.34 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  25.3 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  30.39 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.93 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.14 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.56 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  20.55 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.71 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  25.52 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.61 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.41 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  24.11 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.52 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.19 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  27.59 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.93 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  32.72 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  27.62 
 
 		 115 aa  45.1  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  23.23 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.16 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.72 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.43 
 
 		 157 aa  44.3  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  27.1 
 
 		 172 aa  44.3  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.66 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.86 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  25.31 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  26.54 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.41 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.52 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  25.74 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2931  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  24.49 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>