74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18390  phosphopantetheine-containing protein  100 
 
 		 88 aa  174  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.674444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6560  acyl carrier protein  45.78 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1647  phosphopantetheine-binding  41.25 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546913 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0274  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  35.9 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1711  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  35.9 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1299  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  35.9 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0296  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  35.9 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.444896  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1019  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  35.9 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00932782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1797  Acyl carrier protein  36.84 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  31.43 
 
 		 1939 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  34.62 
 
 		 505 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  34.52 
 
 		 1704 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  34.52 
 
 		 1704 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.86 
 
 		 2762 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  35.82 
 
 		 1474 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  34.52 
 
 		 1704 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3102  phosphopantetheine-binding  30.59 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0141016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 		 1698 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0029  phosphopantetheine-binding  38.98 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3020  phosphopantetheine-binding  30.59 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0027  phosphopantetheine-binding  38.98 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0175854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 2103 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2735  phosphopantetheine-binding  33.78 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5619  polyketide synthase  31.33 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00123968  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5324  beta-ketoacyl synthase  32.91 
 
 		 897 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  30 
 
 		 506 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 		 1656 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  38.33 
 
 		 1744 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.58 
 
 		 544 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1219  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  33.33 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5327  phosphopantetheine-binding  31.43 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4619 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  32.89 
 
 		 4649 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  34.33 
 
 		 7157 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4453  phosphopantetheine-binding protein  31.4 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  31.94 
 
 		 1759 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3405  phosphopantetheine-binding  26.03 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  27.4 
 
 		 2333 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  30 
 
 		 4183 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  32.84 
 
 		 1835 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  30.43 
 
 		 2162 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  28.92 
 
 		 3337 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  35.48 
 
 		 1832 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  25.32 
 
 		 5802 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  31.34 
 
 		 2111 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  34.78 
 
 		 4588 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  35.71 
 
 		 1823 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 2232 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  28.77 
 
 		 2719 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1185  Acyl transferase  32.39 
 
 		 626 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  24.14 
 
 		 2363 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2455  histidine kinase  28.77 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2939  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  30.77 
 
 		 89 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2785  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  30.77 
 
 		 89 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  32.35 
 
 		 2653 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  27.71 
 
 		 5023 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30000  polyketide synthase  31.48 
 
 		 18193 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6231  phosphopantetheine-binding  27.4 
 
 		 167 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1157  putative polyketide synthase subunit  30.77 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1169  beta-ketoacyl synthase  34.67 
 
 		 1778 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  32.35 
 
 		 2726 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0280  polyketide synthase, putative  28.21 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 		 662 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1024  beta-ketoacyl synthase  37.1 
 
 		 2053 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29828  predicted protein  39.22 
 
 		 4962 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  38.16 
 
 		 2085 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  29.63 
 
 		 3525 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  38.16 
 
 		 2085 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5640  beta-ketoacyl synthase  32 
 
 		 1840 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  27.71 
 
 		 3818 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  38.16 
 
 		 2085 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  31.65 
 
 		 4354 aa  40  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1669  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  31.88 
 
 		 90 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0180  hypothetical protein  31.88 
 
 		 90 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1587  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  31.88 
 
 		 90 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.059476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>