23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  100 
 
 		 126 aa  254  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  83.9 
 
 		 121 aa  201  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  82.64 
 
 		 129 aa  201  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  86.49 
 
 		 115 aa  201  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  82.61 
 
 		 122 aa  200  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  82.14 
 
 		 154 aa  187  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  79.13 
 
 		 119 aa  184  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  64.29 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5024  hypothetical protein  61.26 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3776  hypothetical protein  41.96 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1204  hypothetical protein  40.71 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  0.100074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1364  hypothetical protein  40.71 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.703874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1143  hypothetical protein  40.71 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0585  hypothetical protein  63.27 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2283  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  38.33 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4708  hypothetical protein  33.05 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  29.46 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2188  hypothetical protein  30.51 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  31.62 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  29.31 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  41.79 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  31.82 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>