45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0474 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0474  flagellar assembly protein H  100 
 
 
264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0342  flagellar assembly protein H  35.58 
 
 
276 aa  141  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0365  flagellar assembly protein H  35.58 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1643  flagellar assembly protein H  34.83 
 
 
276 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18558  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0220  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  32.05 
 
 
263 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1593  flagellar assembly protein H  32.17 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1356  flagellar assembly protein H  32.35 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0265  flagellar assembly protein H  32.43 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  28.3 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  25.31 
 
 
248 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  25.58 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.56 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  24.69 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  24.69 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.25 
 
 
300 aa  52  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  27.44 
 
 
268 aa  52  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  29.47 
 
 
247 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  27.98 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  22.62 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  22.62 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  24.42 
 
 
251 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  24.46 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  21.67 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  20.83 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  21.67 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  21.67 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  21.67 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  26.44 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  20.36 
 
 
307 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  25 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  24.55 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  25.88 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  24.14 
 
 
306 aa  46.2  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  24.7 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  24.7 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  24.7 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  22.78 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  24.86 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  22.78 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  22.78 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  24.86 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  18.25 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  29.52 
 
 
200 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  22.61 
 
 
238 aa  42  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>