29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0238 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  687    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0483  hypothetical protein  46.08 
 
 		 306 aa  285  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1950  hypothetical protein  28.36 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00445675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  30.92 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  29.93 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  25.49 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  31.29 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  26.89 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  25.81 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  22.79 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  24.73 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  24.3 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  28.02 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  25.62 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  26.63 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  31.85 
 
 		 400 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4453  hypothetical protein  21.18 
 
 		 380 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.868828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  26.92 
 
 		 380 aa  52.8  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  26.37 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  25.33 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  27.33 
 
 		 418 aa  50.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  23.86 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  21.39 
 
 		 463 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  24.44 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  26.88 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2501  hypothetical protein  26.51 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.146955 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  28.57 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2953  hypothetical protein  23.64 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000181957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  22.58 
 
 		 459 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>