15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3013 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3013  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2722  hypothetical protein  87.39 
 
 		 230 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.904105  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0595  hypothetical protein  30.77 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22130  hypothetical protein  25.49 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0137197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  31.63 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  31.63 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  32.32 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  31.64 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  30.39 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  28.33 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2661  hypothetical protein  26.37 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  23.16 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  25.59 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  28.95 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  29.7 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>