35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2304 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2304  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  193  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.250995  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  46.81 
 
 		 1028 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  48.78 
 
 		 1004 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  48.78 
 
 		 1004 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  44.94 
 
 		 986 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  46.34 
 
 		 1007 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  46.34 
 
 		 1007 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  47.56 
 
 		 1004 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  40.86 
 
 		 990 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  39.58 
 
 		 1012 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  41.18 
 
 		 1013 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  37.08 
 
 		 999 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  37.08 
 
 		 999 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  37.08 
 
 		 999 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  37.08 
 
 		 999 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  35.11 
 
 		 1059 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 1006 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 1006 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  34.52 
 
 		 993 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  34.52 
 
 		 993 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  33.33 
 
 		 989 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  36.78 
 
 		 950 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  32.91 
 
 		 995 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  31.65 
 
 		 995 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  32.14 
 
 		 994 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0034  transposase, N-terminal region  38.6 
 
 		 536 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.521113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  30.68 
 
 		 990 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  36.9 
 
 		 969 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  32.98 
 
 		 968 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  29.31 
 
 		 988 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  29.31 
 
 		 988 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  48.78 
 
 		 862 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  48.78 
 
 		 994 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  48.78 
 
 		 550 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  48.78 
 
 		 994 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>