More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0172 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0172  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
339 aa  670    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.719394  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.91 
 
 
334 aa  425  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.09 
 
 
338 aa  421  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 
335 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.06 
 
 
334 aa  411  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 
346 aa  411  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 
346 aa  411  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.92 
 
 
337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 
330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.09 
 
 
334 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.12 
 
 
345 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.82 
 
 
342 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 
335 aa  401  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  56.47 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.06 
 
 
350 aa  398  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.84 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 
339 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 
338 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
348 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 
334 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 
338 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 
334 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 
336 aa  394  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.17 
 
 
346 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.61 
 
 
335 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.15 
 
 
334 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 
334 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 
351 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.96 
 
 
333 aa  391  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.29 
 
 
353 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  54.25 
 
 
341 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 
338 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 
344 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.96 
 
 
333 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 
336 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 
334 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.15 
 
 
334 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.94 
 
 
334 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 
351 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 
338 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 
334 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  53.33 
 
 
336 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
336 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
348 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  53.33 
 
 
336 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.23 
 
 
347 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
334 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 
336 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 
336 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 
336 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.44 
 
 
344 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
336 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.51 
 
 
338 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
336 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 
336 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.36 
 
 
340 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 
333 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.03 
 
 
336 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 
336 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.03 
 
 
336 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 
337 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.15 
 
 
334 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 
333 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
348 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 
333 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.68 
 
 
337 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.15 
 
 
336 aa  388  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
336 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.51 
 
 
352 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.66 
 
 
541 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
336 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.83 
 
 
352 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 
333 aa  388  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
336 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
336 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.03 
 
 
336 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.06 
 
 
343 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.03 
 
 
336 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.08 
 
 
341 aa  385  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 
363 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.03 
 
 
336 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 
347 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 
334 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 
333 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.35 
 
 
352 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 
348 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 
353 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 
334 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.97 
 
 
337 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 
351 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 
334 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 
348 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 
343 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>