41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0783 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  100 
 
 
325 aa  665    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  59.94 
 
 
323 aa  348  6e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  36.91 
 
 
395 aa  229  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  37.3 
 
 
387 aa  196  6e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  39.51 
 
 
404 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  36.89 
 
 
503 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  37.46 
 
 
327 aa  169  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36.25 
 
 
503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  36.22 
 
 
327 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  36.22 
 
 
327 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  33.01 
 
 
332 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  34.86 
 
 
323 aa  146  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  35.58 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  32.84 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  35.31 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  34.27 
 
 
313 aa  122  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  29.21 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  34.36 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  34.8 
 
 
365 aa  108  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  28.9 
 
 
368 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  29.57 
 
 
314 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  29.75 
 
 
314 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  29.94 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  30.85 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  24.92 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  30.43 
 
 
315 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  30.43 
 
 
315 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  31.66 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  26.09 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  25 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  26.69 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  26.26 
 
 
327 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  22.71 
 
 
332 aa  56.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09481  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  33.07 
 
 
319 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.782765  normal  0.0943702 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0279  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  33.07 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.302119  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0056  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  29.66 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1186  pantothenate kinase  37.1 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2775  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  29.09 
 
 
280 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1446  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  30.85 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  27.27 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1538  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  22.77 
 
 
286 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00561271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>